PDB-MCP-Server vs filesystem
并排对比，帮你在这两个 MCP server 之间做选择。
PDB-MCP-Server by Augmented-Nature | filesystem by modelcontextprotocol | |
|---|---|---|
| Stars | ★ 24 | ★ 85,748 |
| 30天用量 | — | — |
| 综合分 | 42 | 77 |
| 官方 | — | ✓ |
| 分类 | 知识库 / RAGAI / LLM 工具开发者工具 | 本地文件系统开发者工具效率工具 |
| 实现语言 | JavaScript | TypeScript |
| 最近提交 | 5 个月前 | 本月 |
PDB-MCP-Server · 概述
一个提供蛋白质数据库结构访问功能的 MCP 服务器，支持搜索、获取和下载。
filesystem · 概述
功能丰富的文件系统操作 MCP 服务器，具有动态目录访问控制功能。
PDB-MCP-Server · 使用场景
- 结构生物学家研究蛋白质结构进行药物发现
- 科学家分析大分子复合物及其相互作用
- 教育机构提供结构生物学数据集访问
filesystem · 使用场景
- 使 AI 模型能够读取和写入项目文件进行开发
- 允许 Claude 或其他 MCP 客户端浏览和分析代码库
- 为内容生成提供对特定目录的安全沙盒访问
PDB-MCP-Server · 安装
npm install
npm run build在 Claude Desktop 中，将其添加到您的 claude_desktop_config.json 文件中：
{
"mcpServers": {
"pdb-server": {
"command": "node",
"args": ["/path/to/pdb-server/build/index.js"]
}
}
}filesystem · 安装
安装
使用 NPX
{
"mcpServers": {
"filesystem": {
"command": "npx",
"args": [
"-y",
"@modelcontextprotocol/server-filesystem",
"/path/to/allowed/directory"
]
}
}
}使用 Docker
{
"mcpServers": {
"filesystem": {
"command": "docker",
"args": [
"run",
"-i",
"--rm",
"--mount", "type=bind,src=/path/to/allowed/dir,dst=/projects/allowed/dir",
"mcp/filesystem",
"/projects"
]
}
}
}VS Code 扩展
点击 README 中的安装按钮直接在 VS Code 中安装。