PDB-MCP-Server vs everything
并排对比，帮你在这两个 MCP server 之间做选择。
PDB-MCP-Server by Augmented-Nature | everything by modelcontextprotocol | |
|---|---|---|
| Stars | ★ 24 | ★ 85,748 |
| 30天用量 | — | — |
| 综合分 | 42 | 77 |
| 官方 | — | ✓ |
| 分类 | 知识库 / RAGAI / LLM 工具开发者工具 | 开发者工具AI / LLM 工具其它 |
| 实现语言 | JavaScript | TypeScript |
| 最近提交 | 5 个月前 | 本月 |
PDB-MCP-Server · 概述
一个提供蛋白质数据库结构访问功能的 MCP 服务器，支持搜索、获取和下载。
everything · 概述
官方 MCP 测试服务器，展示协议全部功能，供客户端开发者使用。
PDB-MCP-Server · 使用场景
- 结构生物学家研究蛋白质结构进行药物发现
- 科学家分析大分子复合物及其相互作用
- 教育机构提供结构生物学数据集访问
everything · 使用场景
- 测试 MCP 客户端实现是否支持所有协议功能
- 通过参考服务器学习 MCP 协议能力
- 验证客户端对不同传输方式的兼容性
PDB-MCP-Server · 安装
npm install
npm run build在 Claude Desktop 中，将其添加到您的 claude_desktop_config.json 文件中：
{
"mcpServers": {
"pdb-server": {
"command": "node",
"args": ["/path/to/pdb-server/build/index.js"]
}
}
}everything · 安装
NPX（推荐）
{
"mcpServers": {
"everything": {
"command": "npx",
"args": ["-y", "@modelcontextprotocol/server-everything"]
}
}
}Windows 用户请使用 cmd /c：
{
"mcpServers": {
"everything": {
"command": "cmd",
"args": ["/c", "npx", "-y", "@modelcontextprotocol/server-everything"]
}
}
}Docker
{
"mcpServers": {
"everything": {
"command": "docker",
"args": ["run", "-i", "--rm", "mcp/everything"]
}
}
}全局安装
npm install -g @modelcontextprotocol/server-everything@latest
npx @modelcontextprotocol/server-everything